a) organizează şi monitorizează expertiza, omologarea şi înregistrarea medicamentelor;
b) recepţionează documentaţia pentru medicamentele prezentate spre autorizare;
c) ţine evidenţa medicamentelor primite pentru autorizare;
d) organizează, în caz de necesitate, evaluarea clinică a medicamentelor prezentate pentru autorizare, în conformitate cu legislaţia în vigoare;
e) organizează evaluarea calităţii medicamentelor prezentate pentru înregistrare;
f) prezintă Ministerului Sănătăţii proiectul de ordin şi, după caz, documentaţia necesară pentru înregistrarea medicamentelor evaluate;
g) întocmeşte, aprobă şi eliberează solicitanţilor autorizaţii, certificate de înregistrare, buletine de analiză;
h) recepţionează cererile şi organizează expertiza şi perfectarea rezultatelor evaluării modificărilor postautorizare;
i) organizează activitatea Comisiei Medicamentului în conformitate cu Regulamentul aprobat de directorul general al Agenţiei;
j) efectuează inspecţii la locul de producere înainte sau/şi după înregistrarea medicamentelor;
k) dispune măsuri de retragere sau interzicere a medicamentelor de pe piaţă conform reglementărilor aprobate.